Esta cidade chamou-se, no início, Canaã, devido às suas riquezas. Atualmente chama-se Parapuã, palavra indígena, significando Rio Feio. A Paróquia foi criada aos 21 de Setembro de 1940 por Dom Henrique Cesar Fernandes Mourão, então Bispo de Cafelândia, tendo como Padroeira a Imaculada Conceição. O Vigário, naqueles tempos, atendia também a Inúbia Paulista, a Osvaldo Cruz e Lucélia que depois se tornaram Paróquias. 

Seu primeiro Vigário foi o Padre Gaspar Aguiló Cortes.